مديرية الهندسة الطبية هي إحدى المديريات التابعة لوزارة الصحة، وترتبط بعطوفة الأمين العام من خلال مساعد الأمين العام للخدمات وهي الذراع الفني لوزارة الصحة في مجال الأجهزة الطبية.
وهي المسؤولة عن خدمات صيانة الأجهزة الطبية الإصلاحية والوقائية ووضع المواصفات الفنية ومتابعة عقود الصيانة و الإشراف المباشر على تجهيز المستشفيات والمراكز الصحية , وتتخذ من الجمعية العلمية الملكية مقراً لها كونها ترتبط باتفاقية تعاون فني بينها وبين وزارة الصحة منذ عام 2001 لتعمل كوادر الفريقين معاً من أجل رفعة الهندسة الطبية والارتقاء بها, و تدار الاتفاقية من خلال لجنة تنفيذية أعضاؤها من كلا الفريقين و يتم تجديدها كل خمس سنوات و بهذا أصبحت مديرية الهندسة الطبية من المديريات الناجحة نتيجة لهذا العمل المشترك لما فيه تحقيق مصلحة المرضى أولاً و خدمة الوطن وأبنائه ثانيا .